Kelas IPA SMA Pusaka Nusantara 2 Bekasi merupakan wadah bagi siswa-siswi yang memiliki minat dan bakat di bidang sains, dengan kurikulum yang dirancang untuk mengasah kemampuan berpikir kritis, analitis, dan eksperimen melalui pembelajaran Biologi, Fisika, dan Kimia yang interaktif dan mendalam.